Dovrebbe derivare dalla forma dialettale del toponimo Zafferana Etnea (CT) oppure da soprannomi derivati dal siciliano zafarana, "zafferano".
Il cognome Zafarana è siciliano, del nisseno, del palermitano e del siracusano. Zaffarana è tipico del catanese. Zafferana, rarissimo, e se si tratta probabilmente di un errore di trascrizione del precedente.