Dovrebbe derivare dalla forma dialettale del toponimo Zafferana Etnea (CT) oppure da soprannomi derivati dal siciliano zafarana, "zafferano".
Il cognome Zafarana è siciliano, del nisseno, del palermitano e del siracusano. Zaffarana è tipico del catanese. Zafferana, rarissimo, e se si tratta probabilmente di un errore di trascrizione del precedente.
Il cognome Zaffarana è 4479° nella regione Sicilia Il cognome Zaffarana è 921° nella provincia di Ragusa Il cognome Zaffarana è 80° nel comune di MILITELLO IN VAL DI CATANIA (CT)