Potrebbe trattarsi di una forma afereticaipocoristica dialettale del nome Eugenio, probabile nome del capostipite, oppure, più probabilmente, deriva dall'aferesi del nome Ingenuinus. Si ricorda con questo nome il santo Ingenuinus conosciuto anche come Genuinus, un vescovo del VII secolo titolare della diocesi di una piccola città vicino a Bressanone in Alto Adige.
Il cognome Genuini, molto raro, ha presenze in Toscana, nell'aretino e senese e nel ternano ed a Roma. Genuino, rarissimo, è del centro Italia.