Potrebbe derivare da nomi di località come Pratolungo di Gavi nell'alessandrino, o meglio, l'antica villa (villaggio) di Pratolongo nei pressi di Montoggio nel genovese, ad indicare il probabile luogo d'origine del capostipite.
Il cognome Pratolongo è ligure, specifico di Genova. Pratolungo, quasi unico, è anch'esso genovese.
Il cognome Pratolungo è 27861° nella regione Lazio Il cognome Pratolungo è 11331° nella provincia di Reggio Nell'Emilia Il cognome Pratolungo è 152° nel comune di PETTENASCO (NO)