L'origine etimologica è oscura, ma alcuni ritengono che potrebbe avere origini albanesi e derivare da un soprannome originato dal termine përleshje, che significa "gran confusione".
Il cognome Peragine è tipicamente pugliese, del barese in particolare. Peragina, praticamente unico, è del barese.
Il cognome Peragina è 20067° nella regione Puglia Il cognome Peragina è 10453° nella provincia di Bari Il cognome Peragina è 655° nel comune di ARCOLA (SP)