Potrebbe derivare da un soprannome originato dal termine dialettale panigh, "miglio", cereale che in epoca medioevale aveva una notevole importanza alimentare per l'uomo, anche se in Lombardia veniva più che altro utilizzato per il foraggio degli animali.
Il cognome Panighi è lombardo, specifico di Milano. Panigo è caratteristico del milanese. Paniga è della provincia di Sondrio.
Il cognome Panighi è 14648° nella regione Emilia-Romagna Il cognome Panighi è 4372° nella provincia di Ravenna Il cognome Panighi è 40° nel comune di GANDELLINO (BG)