Dovrebbe derivare da un soprannome originato dal termine pane pinto, cioè "pane scuro, pane dozzinale", riferito forse ad un capostipite di cui non si avesse una buona opinione.
Il cognome Panepinto è tipicamente siciliano, dell'agrigentino in particolare, ma del palermitano e di Caltanissetta. Pampinto, praticamente unico, è la forma contratta del precedente.
Il cognome Panepinto è 1053° nella regione Sicilia Il cognome Panepinto è 165° nella provincia di Agrigento Il cognome Panepinto è 3° nel comune di SAN GIOVANNI GEMINI (AG)