Dovrebbe derivare dal toponimo Moliterno (PZ) ed indicare il paese di origine della famiglia.
Il cognome Moliterni è tipico della zona che comprende la Basilicata ed il barese.
Moliterno sembra avere anche due ceppi secondari, nel barese e nel napoletano.
Il cognome Moliterno è 2285° nella regione Basilicata Il cognome Moliterno è 1557° nella provincia di Bari Il cognome Moliterno è 5° nel comune di CORLETO MONFORTE (SA)