Dovrebbe derivare direttamente o tramite alterazioni dialettali dal nome slavo Ion (Giovanni, "Dio ha avuto misericordia" o anche "dono del Signore") o dal nome Iona, una forma arcaica del nome biblico Giona.
Il cognome Iona ha un ceppo laziale nel frusinate, a Roma e nel latinense, ed un ceppo nel crotonese . Ionà è tipicamente calabrese, del catanzarese. Ione, quasi unico, è meridionale. Ioni ha un ceppo nel pesarese, un ceppo a Terni ed uno a Roma.