Dovrebbe derivare dall'aferesi di soprannomi originati da nomi bizantini come Christoboulus e Christopholus o dei corrispondenti germanici Töffel e Stoffel (Cristofollin, Stoffolin).
Il cognome Folli ha più ceppi, in Lombardia, Emilia e Romagna, provincia di Genova, Toscana e Lazio. Follini è del piacentino e cremonese. Follis, rarissimo, è piemontese, della zona compresa tra novarese e torinese.
Il cognome Folli è 693° nella regione Emilia-Romagna Il cognome Folli è 98° nella provincia di Lodi Il cognome Folli è 1° nel comune di GALGAGNANO (LO)