Dovrebbe derivare da soprannomi etnici e patronimici del Portogallo ed indicare il luogo di origine dei capostipiti.
Il cognome Portoghese ha vari ceppi distinti, uno a Cagliari, uno a Roma, uno a Napoli, uno a Bari ed uno a Catania, Trapani e Palermo. Portoghesi è esclusivamente romano. Portuese e Portuesi sono piuttosto rari e siciliani.
Il cognome Portoghese è 1501° nella regione Sardegna Il cognome Portoghese è 475° nella provincia di Cagliari Il cognome Portoghese è 58° nel comune di VILLA SAN PIETRO (CA)