Potrebbe derivare dal nome proprio Donato ("donato, regalato (da Dio)") oppure dal termine perdono e dal suo significato di "dono più alto".
Il cognome Perdoni, rarissimo, è specifico del piacentino. Perdon è veneziano e padovano. Perdono o Perdonò è pugliese, del foggiano. Perdonati è quasi unico.
Il cognome Perdono è 4011° nella regione Puglia Il cognome Perdono è 679° nella provincia di Foggia Il cognome Perdono è 35° nel comune di CALVIGNASCO (MI)