Potrebbe derivare dal nome proprio Donato ("donato, regalato (da Dio)") oppure dal termine perdono e dal suo significato di "dono più alto".
Il cognome Perdoni, rarissimo, è specifico del piacentino. Perdon è veneziano e padovano. Perdono o Perdonò è pugliese, del foggiano. Perdonati è quasi unico.
Il cognome Perdoni è 4711° nella regione Emilia-Romagna Il cognome Perdoni è 465° nella provincia di Piacenza Il cognome Perdoni è 30° nel comune di PONTE NIZZA (PV)