Potrebbe derivare dal nome proprio Donato ("donato, regalato (da Dio)") oppure dal termine perdono e dal suo significato di "dono più alto".
Il cognome Perdoni, rarissimo, è specifico del piacentino. Perdon è veneziano e padovano. Perdono o Perdonò è pugliese, del foggiano. Perdonati è quasi unico.