Potrebbe derivare dal nome latino di origine greca Philemon di cui si ha un esempio nel De vita Caesarum di Gaius Suetonius Tranquillus (ca. 70 - ca.130) (Svetonio): "...numquam nocere sustinuit; Philemonem a manu servum, qui necem suam per venenum inimicis promiserat, non gravius quam simplici morte puniit; in Publium Clodium Pompeiae uxoris suae adulterum atque eadem de causa pollutarum caerimoniarum reum testis citatus negavit se quicquam comperisse...".
Il cognome Filomeni, raro, è del Piceno. Filemone e Filemoni sono quasi unici. Filomene, molto raro, parrebbe di Napoli.
Il cognome Filemoni è 8200° nella regione Sardegna Il cognome Filemoni è 3911° nella provincia di Sassari Il cognome Filemoni è 267° nel comune di OSSI (SS)