Dovrebbe derivare dal termine medioevale boterus che indicava chi svolgeva il mestiere di fabbricante di botti.
Tracce di questa cognomizzazione si hanno nel 1500 con lo scrittore e storico Giovanni Botero (1543-1617) originario di Bene Vagienna (Cuneo).
Il cognome Bottero è tipico del Piemonte centromeridionale e della Liguria centrooccidentale. Bottelli è tipico delle province di Varese, Milano e Novara. Botteri è del nord Italia. Botero è quasi unico. Bott è tipico della provincia di Trento. Botter è veneto. Bottesini è lombardo.
Il cognome Botero è 32841° nella regione Sicilia Il cognome Botero è 9437° nella provincia di Messina Il cognome Botero è 488° nel comune di TEZZE SUL BRENTA (VI)