Dovrebbe derivare dal toponimo Varna (BZ) oppure dal nome tedesco Werner, Warner in italiano Guarniero.
Il cognome Varner, rarissimo, ha un ceppo a Lavis (TN) ed uno a Bolzano. Varnerin ha presente in Friuli ed in Veneto. Varnier è presente in provincia di Treviso e di Pordenone.