Dovrebbe derivare dal toponimo Varna (BZ) oppure dal nome tedesco Werner, Warner in italiano Guarniero.
Il cognome Varner, rarissimo, ha un ceppo a Lavis (TN) ed uno a Bolzano. Varnerin ha presente in Friuli ed in Veneto. Varnier è presente in provincia di Treviso e di Pordenone.
Il cognome Varner è 3455° nella regione Trentino-Alto Adige Il cognome Varner è 2354° nella provincia di Trento Il cognome Varner è 76° nel comune di ZIANO DI FIEMME (TN)