Dovrebbe derivare dal termine malgaro, cioè un custode o proprietario di una malga (ricovero di pascoli montani) oppure dal nome medioevale di origine germanica Malgerius di cui si ha un esempio nel XII secolo in Puglia, con il normanno Malgerius d'Altavilla: "...primus Robertus dictus a nativitate Guiscardus, postea totius apuliae princeps et Calabriae dux, vir magni consilii, largitatis et audaciae, secundus Malgerius, ...".
Il cognome Malgeri, molto raro, sembra tipico del sud della Calabria. Malgherini è rarissimo e potrebbe essere pugliese. Malgieri ha presenze nel beneventano, napoletano e foggiano.
Il cognome Malgeri è 3268° nella regione Calabria Il cognome Malgeri è 1136° nella provincia di Reggio Di Calabria Il cognome Malgeri è 18° nel comune di ROCCAFORTE DEL GRECO (RC)