Dovrebbe derivare da modificazioni dell'aferesi del nome Agnese.
Il cognome Gnes è tipico veneziano. Gnesetti, rarissimo, è trentino. Gnesotto è del veronese.
Il cognome Gnesetti è 6975° nella regione Trentino-Alto Adige Il cognome Gnesetti è 3462° nella provincia di Trento Il cognome Gnesetti è 253° nel comune di MEZZOLOMBARDO (TN)