Potrebbe derivare dal nome medioevale Agnello o Agnolo, anche con il significato di Angelo, con l'attributo fra e dovrebbe indicare le famiglie dei figli di un Fratel Agnello o Agnolo, forse un frate ortodosso.
Il cognome Fragnelli è pugliese, specifico del tarantino e del brindisino. Fragnoli, rarissimo, è del casertano.
Il cognome Fragnelli è 1791° nella regione Puglia Il cognome Fragnelli è 298° nella provincia di Taranto Il cognome Fragnelli è 38° nel comune di MARTINA FRANCA (TA)