Potrebbe derivare, direttamente o tramite una forma ipocoristica, da un soprannome basato sul termine dialettale cutrùfo, "caraffa".
Il cognome Cutrufelli, molto raro, è dell'area messinese/catanese. Cutrufo ha un ceppo nel siracusano ed a Catania.
Il cognome Cutrufo è 5113° nella regione Sicilia Il cognome Cutrufo è 795° nella provincia di Siracusa Il cognome Cutrufo è 37° nel comune di NEONELI (OR)