Potrebbe derivare da nomi di località come la contrada Ciafone o Castello Ciaffone di Offida nel Piceno o Colle Ciaffone di Veroli nel frusinate, oppure da soprannomi originati dall'italianizzazione del termine spagnolo chanflòn, "arruffone, grossolano".
Il cognome Ciaffoni ha un ceppo tra ascolano e teramano ed uno a Roma nel frusinate. Ciaffone ha un ceppo nel livornese, uno nell'aquilano ed uno a Roma e nel frusinate. Ciafone è caratteristico del salernitano.
Il cognome Ciaffoni è 1755° nella regione Marche Il cognome Ciaffoni è 403° nella provincia di Teramo Il cognome Ciaffoni è 28° nel comune di AFFILE (RM)