L'origine si deversifica a seconda del ceppo: i ceppi settentrionali dovrebbero derivare da forme aferetiche di un accrescitivo del nome dialettale Zorzo (Giorgio), da Zorzenone per aferesi Zenone; i ceppi meridionali dovrebbero invece derivare dal nome greco Zenon (Zenone). Si ricorda il filosofo greco del V secolo avanti Cristo Zenone di Elea.
Il cognome Zenoni ha un ceppo nel novarese, uno in Lombardia nel bergamasco, nel bresciano ed a Milano, ed uno a Terni. Zenon, quasi unico, dovrebbe essere veneto. Zenone ha un ceppo nel novarese e nel vercellese, ha presenze nel pescarese, un ceppo a Bari ed uno a Napoli.