Deriva da modificazioni dell'aferesi del nome Giovanni (dall'ebraico Yehohanan, "Dio ha avuto misericordia/dono di Dio"). Un principio di queste cognomizzazioni si ha nella seconda metà del 1300 con il pittore senese Francesco di Vannuccio. Si ricorda inoltre il famoso Pietro di Cristoforo Vannucci detto il Perugino (1445-1523) nativo di Città della Pieve (PG).
Il cognome Vannini è più specificatamente toscano ed emiliano.