Potrebbe derivare da una variazione del cognomen latino Scapula o, in data molto più recente, da un soprannome.
Il cognome Scapigliati, molto raro, sembra avere un ceppo nel senese a Piancastagnaio e ceppi anche nel viterbese.
Il cognome Scapigliati è 6394° nella regione Toscana Il cognome Scapigliati è 1076° nella provincia di Siena Il cognome Scapigliati è 17° nel comune di PIANCASTAGNAIO (SI)