Potrebbe derivare dal toponimo Sclafani Bagni della provincia di Palermo o da un toponimo legato al termine scaffa, "buca, fessura", ed indicare il luogo di origine del capostipite.
Il cognome Scaffidi è siciliano, soprattutto messinese.
Il cognome Scaffidi è 498° nella regione Sicilia Il cognome Scaffidi è 40° nella provincia di Messina Il cognome Scaffidi è 1° nel comune di PIRAINO (ME)