Potrebbe derivare da un soprannome dialettale legato al termine lombardo arcaico raffaji, "rapa". Non si può escludere però un collegamento con il nome longobardo Raffhald.
Il cognome Raffaglio, rarissimo, è specifico del sudmilanese.
Il cognome Raffaglio è 10882° nella regione Lombardia Il cognome Raffaglio è 1445° nella provincia di Lodi Il cognome Raffaglio è 99° nel comune di Caselle Landi (LO)