Dovrebbe derivare, direttamente o tramite alterazioni, dal nome antico e medioevale Polidoro (dal greco e significa "gran dono") di cui si ha un esempio nel Genealogie deorum Gentilium secundum Johannem Boccaccium de Certaldo: "...Polidorus, ut testatur Lactantius, filius fuit Agenoris, de quo preter nudum nomen haberi nil puto, esto Theodontius de isto leuem faciat mentionem, sed longe antiquiorem isto Agenore illum dicit...".
Il cognome Polidoro è più tipico di Abruzzo, Lazio, napoletano e Basilicata.
Il cognome Polidoro è 215° nella regione Abruzzo Il cognome Polidoro è 59° nella provincia di Chieti Il cognome Polidoro è 3° nel comune di ORTONA (CH)