E' possibile che il nome derivi dalla regione spagnola di Navarra e sia stato assunto da ebrei marrani trasferitisi in Nord Italia ove facevano gli orefici nel territorio veneziano.
Secondo un'altra ipotesi deriverebbe dal termine navariu, "nocchiero, nocchiere", forse ad indicare l'attività svolta dal capostipite.
Il cognome Navarotto, quasi unico, sembrerebbe veneto.
Il cognome Navarotto è 34559° nella regione Emilia-Romagna Il cognome Navarotto è 6467° nella provincia di Piacenza Il cognome Navarotto è 4364° nel comune di PIACENZA (PC)