Deriva dal nomen latino Nanninus (modificazione dell'aferesi del nome Giovanni) di cui si ha un esempio in Historia Francorum: "...Quod ubi Treverus perlatum est, Nanninus et Quintinus militaris magistri, quibus infantiam filii et defensionem Galliarum Maximus conmiserat, collecto exercitu, apud / Agripinam convenerunt....".
Tracce di questa cognomizzazione si trovano nel 1500 a Firenze con l'erudito Remigium Nanini de Florentia magistrum.
Il cognome Nannini è tipico toscano ed è presente anche nel bolognese.
Il cognome Nannini è 149° nella regione Toscana Il cognome Nannini è 52° nella provincia di Pistoia Il cognome Nannini è 7° nel comune di PONTE BUGGIANESE (PT)
Stemma
Nannini(EMI) (Modena, Ferrara)
Nannini(TOS) (Toscana)
Nannini(EMI) (Bologna) (d'oro, a tre gigli di rosso)