Potrebbe derivare da una forma ipocoristica del nome longobardo Nahilo, o da una contrazione dialettale di un ipocoristico del nome Natale, anche se non si può escludere che possa anche derivare dal fatto che i capostipiti provenissero dal paese di Nalon, una frazione di Vigodarzere nel padovano.
Il cognome Nalin è tipicamente veneto, del padovano, del veronese, del rodigino e del veneziano, con un ceppo anche a Roma e Latina, probabile conseguenza dell'emigrazione veneta in epoca fascista in occasione della bonifica Pontina. Nalini è tipicamente del veronese.