Dovrebbe derivare dal cognome ladino Mus a seguito delle disposizioni dell'Imperatrice Maria Teresa che nel 1700 ordinò che venissero germanizzati tutti i cognomi della zona altoaltesina.
Il cognome Mussner è tipicamente altoaltesino.
Il cognome Mussner è 514° nella regione Trentino-Alto Adige Il cognome Mussner è 155° nella provincia di Bolzano - Bozen Il cognome Mussner è 2° nel comune di SELVA DI VAL GARDENA (BZ)