Potrebbe derivare dal nome medioevale Misenta o Misenti del comune di Misinto della provincia di Milano.
Del toponimo si ha un esempio in una Carta Libelli del 1175 a Milano: "..Arnaldi de Misenti et Ambroxii de Garbaniate et Obizonis Balbi et Ambroxeti Zavatarii, testium...".
Si trovano tracce di questa cognominizzazione nel 1000 in Valtellina, dove i de Misenti occuparono alti incarichi imperiali.
Il cognome Misenta, molto raro, è tipicamente lombardo del comasco.
Il cognome Misenta è 21823° nella regione Lombardia Il cognome Misenta è 1818° nella provincia di Como Il cognome Misenta è 26° nel comune di APPIANO GENTILE (CO)