Dovrebbe derivare dal nome latino Marsilius riportato ad esempio dal Muratori nel 1335: "...Et Marsilius de Carraria Dominabus Paduanis multa jocalia condonavit, et joculatoribus multas vestes: quibus deficientibus, aurumn et argentum pro supplemento largitus est....".
Si ricorda lo scrittore fiorentino cinquecentesco Marsilius Ficinus: "...Marsilius Ficinus Eberardo inclito comiti Virtembergensi et Montis Peligardi seniori salutem plurimam dicit...".
Il cognome Marsili è tipico del centro Italia. Marsilia, molto raro, sembrerebbe campano. Marsilio, ancora più raro, ha un ceppo in Molise ed uno nel napoletano. Marsilli ha un nucleo a Rovereto (TN) ed uno tra udinese e triestino.
Il cognome Marsilli è 1943° nella regione Trentino-Alto Adige Il cognome Marsilli è 1029° nella provincia di Trieste Il cognome Marsilli è 11° nel comune di TRAMBILENO (TN)