Potrebbe derivare da un soprannome originato da un capostipite di nome Antonio, che evidentemente non godesse di buona fama.
Il cognome Malantuono, quasi unico, sembrerebbe dell'area campano/molisana.
Il cognome Malantuono è 2986° nella regione Molise Il cognome Malantuono è 2235° nella provincia di Campobasso Il cognome Malantuono è 22° nel comune di SANT'ANGELO LIMOSANO (CB)