Potrebbe derivare da un soprannome generato da un comportamento disdicevole del capostipite.
Si trovano tracce di questo cognome nel Catasto Onciario dell'anno 1753 di Orsara (FG) con un certo Tomaso Malamisura.
Tra la prima e la seconda metà del 1800 sempre nel foggiano operava il brigante Antonio Malamisura di Monteleone di Foggia, fucilato nel 1863 dalle truppe italiane chiamate a estirpare dalla Capitanata il fenomeno del brigantaggio.
Il cognome Malamisura è sicuramente meridionale, probabilmente pugliese.
Il cognome Malamisura è 15343° nella regione Puglia Il cognome Malamisura è 4817° nella provincia di Foggia Il cognome Malamisura è 116° nel comune di SANT'AGATA DI PUGLIA (FG)