Dovrebbe derivare dal toponimo Magenta (MI).
Originariamente era una nobile famiglia decurionale, di cui si hanno tracce nel 1400, il loro cognome era all'epoca Pedegredis de Mazenta, trasformatosi poi in Mazenta e quindi in Magenta, assidui della corte degli Sforza ed inseriti fra il patriziato milanese, annoverarono nei loro ranghi molti medici, giudici e prelati.
Il cognome Magenta, molto raro, è tipico del milanese occidentale e del pavese settentrionale.
Il cognome Magenta è 2837° nella regione Valle d'Aosta Il cognome Magenta è 704° nella provincia di Pavia Il cognome Magenta è 10° nel comune di GAMBOLÒ (PV)