Potrebbe derivare da una modificazione del nome del toponimo Luino della provincia di Varese.
Fu una famiglia nobile del 1400 di scultori del ramo occidentale del lago di Como; un Cristoforo Luoni, tagliapietre, figura tra gli artisti che nella seconda metà del 1400 lavorò i marmi della Certosa di Pavia e nel 1483 Policleto Luoni fu tra gli scultori che lavorarono a Milano alla costruzione del Portale della facciata della Chiesa di Santa Maria Podone.
Il cognome Luoni è tipico del varesotto, del milanese e del comasco.
Il cognome Luoni è 1175° nella regione Lombardia Il cognome Luoni è 44° nella provincia di Varese Il cognome Luoni è 1° nel comune di CASSANO MAGNAGO (VA)