Dovrebbe derivare da soprannomi di provenienza legati al vocabolo latino popolare longhitanus o longitanus, "lontano, chi è proveniente da lontano", usato per indicare uno straniero del luogo, o al toponimo Longi vicino a Tortorici nel messinese.
Il cognome Longhitano è specifico del catanese, con un ceppo anche nell'ennese. Longitano, quasi unico, dovrebbe essere dovuto ad errori di trascrizione del precedente.
Il cognome Longhitano è 561° nella regione Sicilia Il cognome Longhitano è 119° nella provincia di Catania Il cognome Longhitano è 1° nel comune di BRONTE (CT)