Potrebbe derivare da un soprannome legato al mestiere di coltivazione o commercio dei limoni oppure ad un toponimo come ad esempio Limone Piemonte ed indicare il luogo di origine dei capostipiti.
Il cognome Limone ha un ceppo campano ed uno piemontese, nel torinese. Limoni è sparso nel nord Italia.
Il cognome Limoni è 4041° nella regione Emilia-Romagna Il cognome Limoni è 1668° nella provincia di Bologna Il cognome Limoni è 40° nel comune di BELFORTE MONFERRATO (AL)