Dovrebbe derivare da un soprannome legato al latino caput, "capo, testa", ma anche "dispari" e per estensione "buona fortuna, buona sorte", oppure da una variante del nome Gualfredo (Gaffè, Galfrè).
Il cognome Gaffarelli è tipico del nord Italia. Gaffarello è praticamente unico. Gaffarini è veneto.