Potrebbe derivare dall'unione del termine latino frater, "fratello", ma anche "frate" aggiunto al nome Antonius.
Il cognome Fratantuono ha un ceppo molisano e nel potentino. Fratantoni sembrerebbe siciliano, del ragusano e del messinese.
Il cognome Fratantuono è 1321° nella regione Molise Il cognome Fratantuono è 922° nella provincia di Campobasso Il cognome Fratantuono è 7° nel comune di MARSICOVETERE (PZ)