Dovrebbe derivare dal toponimo Fontaneto d'Agogna (NO).
Tracce di questa cognomizzazione si trovano ad esempio a Venezia nel 1480 con un certo stampatore piemontese Guglielmo di Fontaneto.
Il cognome Fontaneto, abbastanza raro, è circoscritto al novarese.
Il cognome Fontaneto è 3426° nella regione Piemonte Il cognome Fontaneto è 158° nella provincia di Novara Il cognome Fontaneto è 3° nel comune di FONTANETO D'AGOGNA (NO)