Potrebbe trattarsi di una forma ipocoristica dell'italianizzazione del nome cartaginese Filenos o dell'equivalente greco Filannos, nome probabilmente portato dal capostipite.
Il cognome Filannino è specifico di Barletta nel barese, dove è molto diffuso. Filanino, quasi unico, dovrebbe essere dovuto ad un errore di trascrizione del precedente.
Il cognome Filannino è 471° nella regione Puglia Il cognome Filannino è 13° nella provincia di Barletta-Andria-Trani Il cognome Filannino è 3° nel comune di BARLETTA (BT)