L'origine potrebbe essere da un soprannome grecanico originato dal termine greco antico κοϋφον kufon, "leggero, vuoto", o potrebbe anche trattarsi di un'italianizzazione del nome normanno Koffen.
Il cognome Cofano è decisamente pugliese ed è diffuso nel brindisino, ma ha presenze significative anche nel tarantino, nel barese e nel leccese, con un piccolo ceppo a Roma.