Deriva dal toponimo Cisternino in provincia di Brindisi.
Il cognome Cisternino è tipicamente pugliese dell'area che comprende le province di Bari e Brindisi.
Il cognome Cisternino è 346° nella regione Puglia Il cognome Cisternino è 100° nella provincia di Brindisi Il cognome Cisternino è 6° nel comune di MELENDUGNO (LE)