Dovrebbe derivare da nomi di località come Bugnolo nel senese, oppure più probabilmente da soprannomi basati sul termine arcaico bugnola o bugnolo, contenitore di paglia usato per tenervi dentro la biada.
Il cognome Bugnoli ha un ceppo emiliano nel ferrarese ed a Ravenna ed un ceppo a Siena. Bugnola, quasi unico, sembrerebbe del veronese. Bugnolo, molto raro, è piemontese, del vercellese.
Il cognome Bugnoli è 6091° nella regione Emilia-Romagna Il cognome Bugnoli è 996° nella provincia di Ferrara Il cognome Bugnoli è 38° nel comune di GORO (FE)