Dovrebbe derivare da una forma ipocoristica contratta del termine dialettale veneto zovin, "giovane", oppure da una forma dialettale contratta di un diminutivo del nome Giovanni, che dapprima diventerebbe Zovàni e poi Zoni, e nella sua forma ipocoristica Zonin.
Il cognome Zonin è tipicamente veneto, del vicentino e del veronese. Zonini è praticamente unico così come Zonino.
Il cognome Zonini è 60812° nella regione Liguria Il cognome Zonini è 38727° nella provincia di Genova Il cognome Zonini è 26538° nel comune di GENOVA (GE)