Dovrebbe derivare da un soprannome basato sul termine tedesco senn, "cascina alpina, malga", ad indicare il proprietario di una malga o uno che vi lavorasse.
Pare invece meno probabile una derivazione da una forme etnica tedesca riferite alla località Zanon di Ziano di Fiemme in Trentino.
Il cognome Zanoner è caratteristico del Trentino. Sanoner, molto raro, sembrerebbe specifico dell'Alto Adige. Senoner è specifico della provincia di Bolzano.
Il cognome Zanoner è 1569° nella regione Trentino-Alto Adige Il cognome Zanoner è 967° nella provincia di Trento Il cognome Zanoner è 2° nel comune di MOENA (TN)